SAPERE AUSO Małopolska Fundacja Stypendialna została powołana przez Sejmik Województwa Małopolskiego w dniu 28 lipca 2003 r. Akt Notarialny potwierdzający ustanowienie Fundacji został podpisany w dniu 26 sierpnia 2003 r. przez Marszałka Województwa Małopolskiego Janusza Sepioła. Fundusz założycielski Fundacji wniesiony przez Województwo Małopolskie stanowiła kwota 100 000 zł.

Małopolska Fundacja Stypendialna uzyskała wpis do rejestru sądowego i rozpoczęła formalną działalność w dniu 9 grudnia 2003 r. Do tego czasu Województwo Małopolskie wyposażyło Fundację w środki materialne i finansowe umożliwiające utworzenie biura przy ul. Lubelskiej 23 w Krakowie. Wtedy także zakończył się proces kształtowania władz Fundacji, w szczególności Zarządu oraz Rady Fundacji. W skład Rady Fundacji weszli przedstawiciele samorządu, Kościoła, krakowskiego środowiska akademickiego oraz firm, które udzieliły Fundacji wsparcia finansowego.

Formuła organizacyjna „SApere Auso” Małopolskiej Fundacji Stypendialnej pozwala w sposób najbardziej efektywny łączyć środki publiczne (w tym środki Unii Europejskiej) i prywatne w celu realizacji programów stypendialnych dla młodzieży. Do chwili obecnej lista Darczyńców, którzy wsparli działalność statutową Fundacji obejmuje następujące podmioty:

1. Bank BPH SA,
2. BP Polska Sp. z o.o.,
3. ComArch S.A.,
4. Hochtief Polska Sp. z o.o.,
5. Huta Szkła Jaroszowiec,
6. PLUS Discount Sp. z o.o.,
7. Slag Recycling Sp. z o.o.,
8. Saint-Gobain, Delegatura Generalna w Polsce
9. Wojewódzki Fundusz Ochrony Środowiska i Gospodarki Wodnej w Krakowie.
10. Małopolska Agencja Rozwoju Regionalnego S.A.

Fundacja została utworzona przez Województwo Małopolskie jako główny finansowo-organizacyjny instrument realizacji polityki regionalnej w zakresie poprawy szans edukacyjnych młodzieży oraz promocji młodzieży szczególnie uzdolnionej. Dlatego też, udzielane przez „Sapere Auso” stypendia skierowane są przede wszystkim do młodzieży uzdolnionej i aktywnej edukacyjnie, mogącej pochwalić się szczególnymi osiągnięciami na polu działalności naukowej, kulturalnej, sportowej lub ekologicznej. Fundacja wspiera również uczniów i studentów pragnący poszerzać swe umiejętności na kursach specjalistycznych lub poprzez udział w międzynarodowych konkursach i konferencjach. Jedną z form działalności „Sapere Auso” jest także dofinansowanie intensywnych kursów językowych - w roku akademickim 2007/2008 partnerem Fundacji w tym zakresie będzie Szkoła Języków Poliglota .