Mottem Fundacji stały się słowa Sapere auso, czyli Temu, który odważył się być mądrym. Na życzenie króla Stanisława Augusta Poniatowskiego, zostały one wyryte na medalionie ku czci ks. Stanisława Konarskiego, twórcy i założyciela Collegium Nobilium w Warszawie.
Sentencja, będąca strawestowanym cytatem Horacego, pochodzącym z pierwszej księgi jego Listów, odzwierciedla esencję filozofii nazwanej przez samego myśliciela boską mądrością. Poucza ona, iż w młodości warto trudzić się nad zdobyciem kwalifikacji moralnych, intelektualnych oraz rozwijaniem pozytywnych cech charakteru, ponieważ to one właśnie pozwalają człowiekowi uniknąć złego postępowania oraz pomagają w osiągnięciu szczęścia.
Sapere Auso - Małopolska Fundacja Stypendialna stawia sobie za cel wspieranie tych wszystkich, którzy zadają sobie trud bycia mądrymi. 

Horacy, List I, 2, 32-41

Et ni posces ante diem librum cum lumine,
si non intendes animum studiis et rebus honestis,
invidia vel amore vigil torquebere.
Nam cur quae laedunt oculum, festinas demere:
siquid est animum, differs curandi tempus in annum?
Dimidium facti, qui coepit, habet: sapere aude, incipe.

Jeśli książek i światła przed świtem nie żądasz,
umysłu nie nakłaniasz do nauk godziwych -
w noc bezsenną udręczą cię miłość lub zazdrość.
Gdy źdźbło do oka wpadnie, usuniesz bez zwłoki,
a gdy umysł zło toczy, rok po roku zwlekasz?
Kto dobrze zaczął jest już w połowie.
Zaczynaj, miej odwagę być mądrym!

Przeł. Stefan Gołębiowski

Sapere Auso - Małopolska Fundacja Stypendialna  została powołana przez Sejmik Województwa Małopolskiego w dniu 28 lipca 2003 r. Fundusz założycielski Fundacji wniesiony przez Województwo Małopolskie stanowiła kwota pieniężna w wysokości 100.000 zł.

Po uzyskaniu wpisu do krajowego rejestru sądowego Fundacja rozpoczęła formalną działalność w dniu 9 grudnia 2003 r. Do tego czasu Województwo Małopolskie wyposażyło Fundację w środki materialne i finansowe umożliwiające utworzenie biura Fundacji przy ul. Lubelskiej 23 w Krakowie. W lutym 2004 r. zakończył się proces kształtowania władz Fundacji, w szczególności Zarządu oraz Rady Fundacji, w skład której weszli przedstawiciele samorządu, Kościoła, krakowskiego środowiska akademickiego oraz firm, które udzieliły Fundacji wsparcia finansowego. W kwietniu 2005 r. Fundacja uzyskała status organizacji pożytku publicznego.
 

ZADANIA I CELE STATUTOWE  

Fundacja została utworzona przez Województwo Małopolskie jako główny finansowo-organizacyjny instrument realizacji polityki regionalnej w zakresie poprawy szans edukacyjnych młodzieży oraz promocji młodzieży szczególnie uzdolnionej. Stypendia udzielane przez "Sapere Auso" skierowane są przede wszystkim do młodzieży uzdolnionej i aktywnej edukacyjnie, mogącej pochwalić się szczególnymi osiągnięciami na polu działalności naukowej, kulturalnej, sportowej lub ekologicznej. Fundacja wspiera również uczniów i studentów pragnących poszerzać swe umiejętności na kursach specjalistycznych lub poprzez udział w międzynarodowych konkursach i konferencjach.